Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF3Q92576 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms