Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CTTNBP2Q8WZ74 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTTNBP2Q8WZ74 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms