Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC107Q8WV48 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms