Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHR9

PFN4, Profilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN4Q8NHR9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PFN4Q8NHR9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms