Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMCO5AQ8N6Q1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TMCO5AQ8N6Q1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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