Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms