Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAG1Q86YV5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAG1Q86YV5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms