Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SKAP1Q86WV1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms