Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC2Q86VQ3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC2Q86VQ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms