Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXD4L3Q6VB84 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms