Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC27A4Q6P1M0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms