Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PERM1Q5SV97 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms