Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms