Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDCA8Q53HL2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms