Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSD17B12Q53GQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms