Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC153Q494R4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC153Q494R4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms