Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NRF1Q16656 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NRF1Q16656 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms