Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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