Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDB1Q16531 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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