Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ETFDHQ16134 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ETFDHQ16134 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms