Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEDD8Q15843 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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