Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NPTX1Q15818 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPTX1Q15818 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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