Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITSN1Q15811 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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