Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPRKQ15262 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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