Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARHGEF6Q15052 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARHGEF6Q15052 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms