Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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NAE1Q13564 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NAE1Q13564 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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NAE1Q13564 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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NAE1Q13564 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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NAE1Q13564 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NAE1Q13564 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms