Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HDAC1Q13547 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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