Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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GRIK2Q13002 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK2Q13002 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK2Q13002 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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