Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
FOXI1Q12951 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms