Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMARCB1Q12824 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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