Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EP300Q09472 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EP300Q09472 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms