Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
LRP1Q07954 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LRP1Q07954 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms