Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIN1Q05586 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms