Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP2BQ02880 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms