Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC6A3Q01959 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms