Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN7AQ01118 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCN7AQ01118 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms