Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms