Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TFAMQ00059 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms