Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIM1P81133 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIM1P81133 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIM1P81133 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms