Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IL13RA1P78552 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms