Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CABP4P57796 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms