Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EEFSECP57772 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EEFSECP57772 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms