Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RIPPLY3P57055 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RIPPLY3P57055 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RIPPLY3P57055 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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