Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2BFSP57053 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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