Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PGGT1BP53609 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGGT1BP53609 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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