Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SMARCA4P51532 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMARCA4P51532 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms