Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GCLMP48507 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GCLMP48507 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GCLMP48507 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms