Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABRA4P48169 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms