Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms