Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD52P43351 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD52P43351 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD52P43351 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms